Für Chemiker*innen ist es von entscheidender Bedeutung, die Vorteile der verschiedenen Repositorien zu kennen, um die beste Lösung für ihre Forschungsdatenanforderungen zu finden. Im Rahmen unserer Reihe “Repositorien im Profil” geben wir hier einen kurzen Überblick über MassBank EU.
MassBank EU – Massenspektraldatenbank von hoher Qualität
Grundlegende Informationen
❏ Homepage: https://massbank.eu/MassBank/
❏ Erstellungsdatum: 2006
❏ Land: DE, JPN
❏ Bereich: Chemie, Biowissenschaften
❏ Verwendung: Freier Zugang
❏ Zielgruppe: Analytische Chemiker*innen, Metabolomiker*innen, Biochemiker*innen, Bioinformatiker*innen
❏ Benutzerdokumentation: Ist auf der Website verfügbar
❏ Anzahl der Datensätze: https://massbank.eu/MassBank/RecordIndex
❏ Empfohlen von Fachzeitschriften/Gesellschaften: Offizielle Datenbank der Massenspektrometrie-Gesellschaft von Japan
❏ Aufgeführt in: re3data: r3d100011839, FAIRsharing: FAIRsharing.dk451a, bio.tools: massbank, Wikidata: Eigenschaft:P6689 Q24088019, Identifiers.org: massbank, PubChem: Datenquelle ID: 23999
Funktionalitäten und technische Informationen
❏ Inhalt: Massenspektraldaten von bekannten, unbekannten und vorläufig identifizierten Stoffen
❏ Herkunft der Inhalte: Von Benutzer*innen und Projekten der Community
❏ Durchsuchbare Inhalte: Informationen zu Verbindungen und Massenspektrometrie, Peaks
❏ Akzeptierte Datentypen: MassBank-Format
❏ Verwendete Standards/Ontologien: Internes MassBank-Datensatzformat
❏ Kuratierung: Über MassBank-Datensatz-Validator; GitHub-Themen
❏ Zugangsrechte/Lizenzinformationen/Embargo: Urheberrecht; individuelle Lizenzen auf der Grundlage von Creative Commons; kein Embargo
❏ AAI-Lösung: GitHub (Lesezugriff unkontrolliert, Schreibzugriff für erlaubte GitHub-Konten)
❏ Persistentes Identifizierungssystem: MassBank Record ID (Accession), USI (Universal Spectrum Identifier)
❏ Kennzeichnungssystem der Behörde: Nein
❏ Verwendete Software: https://massbank.github.io/MassBank-documentation/developer_documentation.html; https://github.com/MassBank/MassBank-web
❏ S chnittstellen: Schnittstelle für Datenimport über Git (MassBank-Datensatzformat), Schnittstelle für Datenexport (JSON-LD), REST API
❏ Weitere Funktionen/Tools: RMassBank (separates Datenverarbeitungs-/Analysetool)
